Os aptâmeros de DNA emergiram como ferramentas essenciais de biemagem, biemagem e terapêutica, mas seu desenvolvimento tem sido um pouco limitado devido à falta de entendimento de suas terceiras estruturas e mecanismos de ligação. Pesquisas recentes se concentraram na importância do TriFosfato de Adenosina (ATP), que, como o principal objetivo do desenvolvimento dos aptmen, relatou a um ATP estar conectado a uma constante disciplinar (KD) de cerca de 2,5 µm. Apesar desse progresso, a base estrutural para a validação de ATP é pouco conhecida, o que dificulta o progresso.
Parte das ciências da academia chinesa, uma equipe de pesquisadores da Federação Médica do Instituto Hongzo fez um progresso significativo no campo, como um estudo publicado no processo de ciências da National Academy Sci F. Sob a liderança dos professores Ten Wehong, Han Da e Guo Pi, a equipe determinou com sucesso a terceira composição do complexo de ligação do DNA Aptmer-ATP 1: 1. Os métodos de crença envolvidos neste trabalho foram claros e a engenharia do Optim Pimise DNA Aptmer exibindo um impressionante CD submicromolar para a ligação ATP é capaz da engenharia dos aptmen de DNA de ligação ATP até o momento.
Para alcançar esses resultados, os pesquisadores usaram a espectroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN) para analisar o tipo curto de estruturas de solução do Pt Ptemer original chamado 1301B_V1. Eles descobriram que essa estrutura mostra uma arquitetura de um braço “L”, no qual o ATP intercluting em uma bolsa de ligação moldada por dois loops interiores. A ligação é mais estabilizada pela ligação de hidrogênio com a interação Gunine e empilhamento com uma base próxima.
Este estudo também revelou que os íons magnésio (MG) desempenham um papel crucial na facilitação da formação de uma estrutura semi-dobrada em 1301B_V1. Esses íons estabilizam o complexo de ligação neutralizando os grupos fosfato de carga negativa no DNA e no ATP, mostrando o método de validade adaptável para ATP para ATP.
Para melhorar a conexão de ligação, os pesquisadores introduziram alterações em 2′-O-metil nos principais resíduos na junção central do Pt Ptemer. Essa alteração melhorou significativamente a ligação de ligação e reduziu a dependência dos íons MG²⁺. A variante Optime Ptimise resultante recebeu um caddy submicromolar de cerca de 0,7 .M, mantendo a singularidade para o ATP.
Esses achados mostram o potencial desordenado do DNA para formar terceiros estruturas complexas e fornecer informações valiosas no design de equipamentos moleculares de DNA de alto desempenho. Tais progressos têm efeitos promissores para várias aplicações, incluindo diagnóstico e estratégias terapêuticas direcionadas.
